Axel blev gift med Olga Anna Sophie Schumacher den 27 okt. 1904 i Garnison Kirke. Olga blev født den 28 okt. 1879 i København; blev døbt den 11 jan. 1880 i Garnison Kirke; døde den 15 apr. 1957 i København; blev begravet den 17 apr. 1957 i Bispebjerg Krematorium. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Ivar Johan Heinrich Ek blev født den 11 maj 1906 i Helsingborg, Sverige; og døde.
2. Viggo Axel Wilhelm Ek blev født den 3 dec. 1911 i Helsingborg, Sverige; blev døbt den 26 dec. 1911 i Maria Församlingen; og døde.